新城疫病毒分离株F基因的克隆与序列分析

编号 zgly0001362222

文献类型 期刊论文

文献题名 新城疫病毒分离株F基因的克隆与序列分析

作者 袁萍  闫丽辉  成进  汪萍  柏庆  李延涛 

作者单位 新疆天康畜牧生物技术股份有限公司  中国农业科学院哈尔滨兽医研究所哈尔滨维科生物技术开发公司  新疆畜牧科学院兽医研究所 

母体文献 动物医学进展 

年卷期 2009年03期

年份 2009 

分类号 S852.65 

关键词 新城疫病毒  F基因  克隆  序列分析 

文摘内容 应用RT-PCR分别扩增出新城疫病毒(NDV)青海株(QH3)、黑龙江株(HLJ)和甘肃株(A4)的融合蛋白(F)基因的全长核苷酸,再克隆到pMD18-T载体中。经酶切和质粒PCR鉴定,获得阳性重组质粒后,进行序列测定并推导出其氨基酸序列,同时进行分析和比较。序列分析结果表明,所获得的3个分离株F基因完整的开放阅读框长度为1662bp,共编码F蛋白的553个氨基酸;3个毒株之间的核苷酸序列同源性为88.0%～90.6%;与常用疫苗株之间核苷酸序列同源性只有85.3%～91.6%。三者F基因的裂解位点均为112R-R-Q-K/R-R-F117,符合强毒株裂解区氨基酸组成的特征。以1bp～374bp的核苷酸序列绘制系统发育树分析表明,QH3株NDV为基因Ⅷ型,A4株NDV为基因Ⅵ型,HLJ株NDV为基因Ⅸ型。