新城疫病毒山东分离株ShD-5-06 F和HN基因序列分析

编号 zgly0001340268

文献类型 期刊论文

文献题名 新城疫病毒山东分离株ShD-5-06 F和HN基因序列分析

作者 岳楚昕  莫贞峰  李颖  刘栋  朱剑英 

作者单位 济南市畜牧办公室 

母体文献 动物医学进展 

年卷期 2008年08期

年份 2008 

分类号 S852.659.5 

关键词 新城疫病毒  生物学特性  F基因  HN基因  序列分析 

文摘内容 从山东济南某非典型新城疫发病鸡群中分离到一株新城疫病毒株(ShD-5-06),研究其生物学特性表明,该病毒具有新城疫强毒株的一些特征。从该分离株扩增出其F和HN基因,并与标准株进行同源性比较,为探讨NDV是否发生变异提供理论依据。本试验通过RT-PCR法特异性地扩增出F和HN基因全基因序列,并对其与已经发表的序列进行核苷酸序列测定和分析。结果表明,ShD-5-06株的F和HN基因开放性阅读框架(ORF)为1 662 bp和1 716 bp,分别编码489个和571个氨基酸。与国外发表的部分新城疫病毒强毒株和弱毒株之间相应序列进行比较,F基因核苷酸序列的同源性在84.1%~88.7%之间,氨基酸同源性在88.1%~93.3%之间;HN基因核苷酸序列的同源性在82.1%~87.4%之间,氨基酸同源性在88.6%~90.9%之间;F蛋白裂解位点区(112~117)氨基酸组成与强毒株一致,说明NDV山东分离株(ShD-5-06)为新城疫强毒株。