苎麻BnMAN1基因及其启动子的克隆分析

编号 zgly0001639802

文献类型 期刊论文

文献题名 苎麻BnMAN1基因及其启动子的克隆分析

作者 马玉申  刘泽航  揭雨成  邢虎成 

作者单位 湖南农业大学苎麻研究所  湖南省种质资源创新与资源利用重点实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年13期

年份 2018 

分类号 S563.1 

关键词 苎麻  β-甘露聚糖酶  BnMAN1  启动子  生物信息学分析 

文摘内容 甘露聚糖酶基因在植物种子萌发、果实的成熟软化、植物器官的脱落以及非生物胁迫等过程发挥重要作用。为研究其在苎麻中的基因功能,本研究根据苎麻转录组测序中的Bn MAN1片段序列,克隆该基因的c DNA全长及其上游的调控序列。生物信息学分析发现:Bn MAN1基因上游的调控序列包括TATA-box、CAAT-box、AE-box、Box 4、I-box、GAG-motif、GATA-motif、Skn-1motif、ARE、Aux RR-core、TCA-element、MBS等顺式作用元件。Bn MAN1基因开放阅读框为1 128 bp,编码375个氨基酸,预测其相对分子质量为42.47 k D,理论等电点为9.45。与桃树（ABV32548）、苦瓜（XP022132624）、毛果杨（XP006383170）、野生大豆（KHN36084）和橡胶树（XP021678603）氨基酸序列相似性分别为82%、81%、79%、79%、76%。蛋白的二级结构中α-螺旋约占45.33%,延伸链约为15.20%,无规则卷曲约为39.47%。结构域分析发现具有COG3934、Cellulase结构域,属于β-甘露聚糖酶类。苎麻Bn MAN1及其启动子将为今后对该基因在苎麻中的功能研究提供帮助。