大薯病程相关蛋白1(PR1)基因及其启动子序列的克隆与分析

编号 zgly0001577142

文献类型 期刊论文

文献题名 大薯病程相关蛋白1(PR1)基因及其启动子序列的克隆与分析

作者 张青  赵景梅  黄东益  肖鑫辉  夏薇  许云  黄小龙  吴文嫱 

作者单位 海南大学热带农林学院  中国热带农业科学院热带作物品质资源研究所 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年07期

年份 2018 

分类号 S436.32 

关键词 大薯  病程相关蛋白1  启动子  基因克隆  生物信息学分析 

文摘内容 为了研究大薯Da PR1基因的表达模式及调控机理,本研究利用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)技术,从高抗炭疽病大薯材料Da94中获得1个病程相关蛋白1(pathogensis-related protein 1,PR1)基因,命名为Da PR1。测序显示该基因包含长度为501 bp的完整开放阅读框(ORF),预测编码166个氨基酸。生物信息学分析表明该基因编码的蛋白具有典型SCP-PR1-like保守结构域,Blast比对表明Da PR1蛋白与多种植物的PR1蛋白高度同源。实时荧光定量PCR检测表明,Da PR1基因在高抗种质中受炭疽菌显著诱导,在侵染48 h时其相对表达量达到最大。通过巢式PCR扩增Da PR1上游转录调控序列的5’端,获得1 203 bp的Da PR1基因启动子,序列分析表明该区域除了含有基础的启动子元件CAAT-box和TATA-box外,还存在茉莉酸(JA)、赤霉素(GB)等激素响应元件及真菌诱导响应元件(W-box)。本研究通过克隆和分析Da PR1基因及其启动子序列,为进一步研究该基因的功能及其表达调控机制奠定了基础。