甜瓜粉霉病菌效应蛋白编码基因的预测与分析

编号 zgly0001719790

文献类型 期刊论文

文献题名 甜瓜粉霉病菌效应蛋白编码基因的预测与分析

作者 范春霞  王军节  赵鲁迺克  杨昊铮 

作者单位 北方民族大学植物性农产品贮藏与加工重点实验室  北方民族大学生物科学与工程学院 

母体文献 植物病理学报 

年卷期 2020年05期

年份 2020 

分类号 S436.5 

关键词 粉红单端孢  甜瓜粉霉病  生物信息学分析  效应蛋白  实时荧光定量PCR 

文摘内容 粉霉病是一种严重影响甜瓜果实品质并造成经济损失的采后病害,效应蛋白在病原真菌致病机制中发挥着重要作用。为获得引起甜瓜粉霉病病原菌粉红单端孢(Trichothecium roseum)的效应蛋白,本研究利用一系列生物信息分析软件(SignalP, TMHMM, Protcomp, big-PI Predictor, TargetP和Blastp)对该菌进行效应蛋白预测与分析,并采用实时荧光定量PCR检测其中6个候选效应蛋白编码基因在离体诱导培养和接种果实时的表达模式。结果表明:从T.roseum的9 760个蛋白序列中预测得到154个候选效应蛋白,其中64个具有功能注释,其余为功能未知蛋白;候选效应蛋白的信号肽长度在14～30 aa之间,且大部分是由信号肽酶I型进行识别;信号肽中出现频率最高的氨基酸依次为丙氨酸、亮氨酸和丝氨酸;其中5个候选效应蛋白编码基因在离体诱导条件下和接种果实时表达量均显著升高,说明其可能为真正的效应蛋白。本研究预测获得了T.roseum中的效应蛋白,实时荧光定量PCR分析说明效应蛋白编码基因参与了T.roseum侵染甜瓜果实的致病过程,这些结果为进一步分析效应蛋白的功能与致病机制奠定了基础。