基于松属不同树种EST序列的马尾松SSR引物开发

编号 zgly0001436548

文献类型 期刊论文

文献题名 基于松属不同树种EST序列的马尾松SSR引物开发

作者 王晓锋  季孔庶  何卫龙 

作者单位 南京林业大学  湖南省林业科学院 

母体文献 湖南林业科技 

年卷期 2013年01期

年份 2013 

分类号 S791.248 

关键词 松属  马尾松  EST  SSR 

文摘内容 利用松属5个树种的EST序列,分别树种查找SSR位点,采用Primer3.0软件进行引物设计。设计的5个树种的EST—SSR引物中:所占比例最高的均为三核苷酸重复,其次是六核苷酸重复,两者之和都达到了64%以上;四核苷酸重复所占比例均为最低。从设计的引物中分别不同树种各选取20对进行引物合成和通用性检测以及马尾松群体检测,结果表明:松属5个树种的EST序列开发的马尾松SSR引物,其在马尾松中的扩增成功率为60%～80%;最高的是辐射松,最低的是海岸松,平均为72%。通用性最好的为辐射松,属内的通用性为94%;属间和科间通用性也分别达到75%和44%。不同树种序列来源的EST—SSR引物,其扩增成功率在10%～30%;最高的是北美短叶松,其次是辐射松,最低的是扭叶松和火炬松;平均为17%。