藏羊IFN-γ基因的扩增、序列分析及蛋白结构预测

编号 zgly0001516963

文献类型 期刊论文

文献题名 藏羊IFN-γ基因的扩增、序列分析及蛋白结构预测

作者 张晓芬  冶贵生  文熙萍  祁秀清 

作者单位 青海大学农牧学院省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室 

母体文献 动物医学进展 

年卷期 2016年11期

年份 2016 

分类号 S826 

关键词 藏羊  IFN-γ基因  反转录-聚合酶链反应  序列分析  蛋白结构预测 

文摘内容 为了研究藏羊IFN-γ基因的功能,提取藏羊脾脏总RNA,通过RT-PCR扩增藏羊IFN-γ基因并测序,应用DNA Star软件进行序列分析及编码蛋白结构预测。结果表明,藏羊IFN-γ基因长度为429bp,其中腺嘌呤和胸腺嘧啶含量较高,该基因编码143个氨基酸,其中疏水性氨基酸和亲水性氨基酸的含量较高。藏羊IFN-γ基因与参考绵羊、山羊、藏羚羊和牛IFN-γ基因的核苷酸序列同源性依次为100%、99.3%、99.1%和97.2%,氨基酸序列同源性依次为100%、99.3%、99.3%和95.8%。IFN-γ蛋白主要由α螺旋组成,亲水性较高,含有5种蛋白质功能位点,分别为1个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、1个酰胺化位点、2个N-糖基化位点、2个cAMP和cGMP依赖的蛋白激酶磷酸化位点和3个蛋白激酶C磷酸化位点。