中国水仙凝集素基因NTA的克隆、序列分析及蛋白结构预测

编号 zgly0000631133

文献类型 期刊论文

文献题名 中国水仙凝集素基因NTA的克隆、序列分析及蛋白结构预测

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 刘文凤  侯成林  高健  沈昕 

作者单位 北京林业大学生物科学与技术学院  国际竹藤网络中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室  首都师范大学生命科学院 

母体文献 基因组学与应用生物学 

年卷期 2009,28(2)

页码 216-222

年份 2009 

分类号 Q513  S763.721.1 

关键词 中国水仙  NTA  基因克隆  序列分析  蛋白结构预测 

文摘内容 凝集素是一种糖专一性结合蛋白，它可以识别不同的糖类。植物凝集素是植物防御系统重要的组成部分。本研究采用RT-PCR的方法，从中国水仙花蕾中克隆了凝集素基因Ⅳ孤，运用生物信息学方法对其核苷酸序列、编码的氨基酸序列进行分析以及对其蛋白结构进行预测。结果表明，得到的NTA基因全长698bp，包含一个完整的开放阅读框516bp。该基因编码一个含有172个氨基酸的凝集素前体蛋白，该前体蛋白的等电点和分子量分别为5.84和18615.19Da。序列比对结果表明该基因编码的蛋白与其他单子叶植物如杂种水仙、雪花莲、君子兰、石蒜花和孤挺花的凝集素蛋白的同源性较高，分别为84％、80％、77％、78％以及82％。蛋白结构预测表明，中国水仙凝集素蛋白与洋水仙凝集素蛋白在结构上非常相似。对该基因编码的蛋白进行分析及蛋白结构模拟可知，该蛋白含有三个特殊的功能结构域和alpha-D-甘露糖结合表面（QXDXNXVXY）。