巴西橡胶树HbRD22基因的电子克隆与生物信息学分析

编号 zgly0000686588

文献类型 期刊论文

文献题名 巴西橡胶树HbRD22基因的电子克隆与生物信息学分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 高静  程汉  蔡海滨  安泽伟  黄华孙 

作者单位 中国热带农业科学院橡胶研究所国家橡胶树育种中心  中国热带农业科学院科技信息研究所 

母体文献 热带作物学报 

年卷期 2010(9)

页码 1439-1445

年份 2010 

分类号 S794.1 

关键词 巴西橡胶树  HbRD22基因  电子克隆  生物信息学 

文摘内容 利用电子克隆技术从低温诱导的巴西橡胶树全长cDNA文库中获得了HbRD22基因,该基因全长1 458 bp。生物信息学分析结果表明,HbRD22编码一个由338个氨基酸组成的、相对分子量为36.96 ku、等电点为7.65的多肽,并含有一个由217个氨基酸组成的BURP结构域。其推导的氨基酸序列与葡萄的同源性最高,达69%。信号肽预测结果表明HbRD22蛋白为分泌型蛋白,前21个氨基酸区域为信号肽区域。Northern blotting分析结果表明,该基因在正常生长情况下,表达水平较高,干旱胁迫后24 h,表达量逐渐减低,直至检测不到,揭示该基因受干旱胁迫负调控。