木薯MeZnT11基因的电子克隆与生物信息学分析

编号 zgly0001706579

文献类型 期刊论文

文献题名 木薯MeZnT11基因的电子克隆与生物信息学分析

作者 杜尚广  余波 

作者单位 南昌师范学院生物系 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2020年05期

年份 2020 

分类号 S533 

关键词 木薯  青枯病  ZnT11基因  电子克隆  生物信息学 

文摘内容 锌转运体(zinc transporter11, ZnT11)基因是植物响应逆境胁迫和病理反应的重要基因,在维持细胞稳态和活力方面发挥关键作用,克隆木薯(Manihot esculenta) ZnT11基因对其抵抗青枯病的机理研究具有重要意义。为得到木薯ZnT11基因并预测表达蛋白的性质,本研究采用电子克隆技术获得其cDNA序列,并使用生物信息学分析方法,对预测蛋白的基本理化性质、同源序列及系统进化等进行全面解析。结果表明,木薯ZnT11基因cDNA序列全长1 533 bp,其开放阅读框有1 038个碱基,预测蛋白包含346个氨基酸,具有酸性和疏水性,定位于质膜,具有9个跨膜螺旋区。通过多重比对和系统发育分析可知,木薯与巴西橡胶树(Hevea brasiliensis)、蓖麻(Ricinus communis)和麻疯树(Jatropha curcas)等植物中的ZnT11蛋白同源性较高。该研究结果拟为木薯基因克隆、载体构建及遗传转化提供参考。