毛果杨WND1B基因启动子的克隆与缺失初步分析

编号 zgly0001435599

文献类型 期刊论文

文献题名 毛果杨WND1B基因启动子的克隆与缺失初步分析

作者 黄婷  徐刚标 

作者单位 中南林业科技大学林木遗传育种实验室 

母体文献 中南林业科技大学学报 

年卷期 2012年04期

年份 2012 

分类号 S792.119 

关键词 启动子  5’调控序列  克隆  生物信息学 

文摘内容 毛果杨Populus trichocarpa WND1B基因是拟南芥纤维细胞次生壁加厚中关键性调控因子SND1的同源基因。根据其序列进行BLAST分析,设计引物,用PCR方法克隆了WND1B起始密码子上游约2100 bp的5’调控序列。序列分析表明,该序列含典型的真核生物核心启动子区域,一些与真核生物典型的顺式调控元件相似的TATA-box、增强子元件、CAAT-box、GATA-box也存在于其中,此外还发现了一些与激素、低温胁迫诱导相关的顺式作用元件。分别设计引物,获得WND1B启动子的缺失序列。构建其表达载体pCAMBIA1301POG-1BP/1BP-F2/1BP-F3/1BP-F4-GUS,并进行瞬时表达分析。GUS染色表明,PtrWND1BP/1BP-F3/1BP-F4序列具GUS活性,PtrWND1BP-F2序列不具有。这说明PtrWND1B 5’非编码区影响其启动子活性。