油棕(Elaeis guineensis)中果皮发育过程中miRNA的表达动态分析

编号 zgly0001461638

文献类型 期刊论文

文献题名 油棕(Elaeis guineensis)中果皮发育过程中miRNA的表达动态分析

作者 方良  梁远学  李东栋  曹献英  郑育声 

作者单位 海南省热带生物资源可持续利用重点实验室海南大学材料化工学院 

母体文献 植物科学学报 

年卷期 2013年03期

年份 2013 

分类号 S565.9 

关键词 油棕  脂肪酸代谢  miRNA  实时定量PCR  靶基因预测 

文摘内容 以CTAB法提取油棕(Elaeis guineensis)中果皮5个不同发育时期(G1～G5)的小RNA。从前期研究获得的油棕小RNA测序数据库中筛选12个候选miRNA,实时荧光定量PCR法(qRT-PCR)检测其在果实发育过程中的表达量变化,并进一步对显著差异表达的miRNA进行靶基因预测。结果表明:中果皮5个不同发育时期小RNA的OD260/OD280比值在1.7～2.0之间;浓度分别是289、364、476、213、390 ng/μL;qRT-PCR检测结果显示,12个候选miRNA在5个发育时期均显著性差异表达,特别是在中果皮发育第4个时期(G4)和第5个时期(G5)表达量极显著增高,其中miR395和miR156在第4个时期表达量最高;miR395和miR528在发育第5时期表达量最高;靶基因预测结果显示差异表达的部分miRNA,其靶基因可能参与了脂肪酸代谢通路,如磷脂酸磷酸脂酶和磷脂酶D。本研究筛选的与脂肪酸代谢相关的miRNA为今后油棕脂肪酸代谢调控通路研究提供了可能的线索。