马尾松大小径材miRNA的差异表达分析

编号 zgly0001721181

文献类型 期刊论文

文献题名 马尾松大小径材miRNA的差异表达分析

作者 周紫晶  范付华  尚先文  覃慧娟  王聪慧  丁贵杰  谭健晖 

作者单位 贵州大学贵州省森林资源与环境研究中心/贵州省高原山地林木培育重点实验室  贵州大学林学院  广西壮族自治区林业科学研究院 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2020年10期

年份 2020 

分类号 S791.248 

关键词 马尾松  大径材  小径材  miRNA  生长发育 

文摘内容 本研究采用Illumina HiSeq 2500高通量测序技术对马尾松大径材和小径材进行小RNA分子测序,构建了6个小RNA文库,共检测到1.42×107～1.59×107条序列。鉴定得到1 567个miRNA,其中已知保守miRNA 783个,新miRNA 784个;差异表达miRNA 67个,其中31个在大径材马尾松中显著上调, 36个显著下调。最终预测得到28 044个靶基因, 67个差异表达miRNA对应592个靶基因, GO分析表明这些差异表达的miRNA主要参与了细胞组分、分子功能和生物过程中共计27个类别, KEGG分析表明它们参与了44种不同的途径。利用实时荧光定量PCR验证了4个差异表达miRNA的表达趋势与小RNA测序结果相似,且对其靶基因可能起负调控作用。结果表明某些miRNA (如miR171、miR397、novel-m0462-5p、novel-m0101-3p、novel-m0504-3p、novel-m0279-3p等)可能参与马尾松生长发育过程,对马尾松的次生生长、维管形成层发育过程、木质素生物合成和植物激素信号转导过程等多方面产生作用,从而造成马尾松大径材和小径材的差异。本研究为今后马尾松大径材的培育工作提供参考。