小花碱茅HKT2;1基因全长cDNA的克隆与生物信息学分析

编号 zgly0001624949

文献类型 期刊论文

文献题名 小花碱茅HKT2;1基因全长cDNA的克隆与生物信息学分析

作者 李剑  张金林  王锁民  郭强 

作者单位 兰州大学草地农业科技学院草地农业生态系统国家重点实验室 

母体文献 草业学报 

年卷期 2013年02期

年份 2013 

分类号 S156.4  S184 

关键词 小花碱茅  PutHKT2  1基因  克隆  生物信息学分析  耐盐性 

文摘内容 Na+是盐渍化土壤中主要的毒害离子,对植物生长发育和农业生产构成严重威胁。高亲和性K+转运蛋白HKT2;1在控制高等植物Na+吸收,增强K+的选择性,进而提高耐盐性方面发挥着重要作用。本研究以拒盐型牧草小花碱茅为材料,采用RT-PCR和RACE(rapid amplification of cDNA ends)方法克隆到HKT2;1基因,并命名为PutHKT2;1。该基因全长1 919bp,包含1个长1 638bp的开放阅读框(ORF),编码546个氨基酸,推测分子量为60.5kDa,等电点PI为9.07。与其他植物HKT2;1氨基酸序列同源性多在66%以上,核苷酸序列同源性都在75%以上。PutHKT2;1可能跨膜11次,二级结构分析表明,PutHKT2;1蛋白含有47.99%α-螺旋、5.13%β-转角、31.87%无规则卷曲和15.01%延伸链。PutHKT2;1基因全长cDNA的克隆及其生物信息学分析为进一步揭示小花碱茅拒盐的分子机制奠定了基础。