银杏GbGGPS基因的克隆及序列分析

编号 zgly0000819449

文献类型 期刊论文

文献题名 银杏GbGGPS基因的克隆及序列分析

学科分类 220.45;经济林学

作者 张洪娟  谭碧玥  曹福亮 

作者单位 南京林业大学森林资源与环境学院 

母体文献 南京林业大学学报: 自然科学版 

年卷期 2013(4)

页码 8-12

年份 2013 

分类号 Q786 

关键词 银杏萜内酯  牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(GGPS)  蛋白质结构  生物信息学分析 

文摘内容 利用RACE技术克隆并获得了银杏牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因(GbGGPS基因)。银杏GbGGPS基因的cDNA全长为1 641 bp,含有1个1 176 bp的可读框,编码391个氨基酸序列。生物信息学预测GbGGPS蛋白的分子质量为42.51 ku,理论等电点为5.98,N端有叶绿体信号肽,其二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成。蛋白质同源分析表明,GbGGPS含有多聚异戊二烯基合成酶家族中保守的5个特征性结构域和2个富含天冬氨酸的区域。同源建模分析显示GbGGPS序列与薄荷GGPS蛋白的三维结构及活性位点高度相似。系统进化分析表明,银杏GGPS蛋白归属植物进化支,且与加拿大红豆杉、挪威云杉、北美冷杉的GGPS蛋白归为同一分支。