牦牛SCD基因的克隆和生物信息学分析

编号 zgly0001634463

文献类型 期刊论文

文献题名 牦牛SCD基因的克隆和生物信息学分析

作者 付东海  吴晓云  王宏博  褚敏  郭宪  裴杰  包鹏甲  丁学智  阎萍  梁春年 

作者单位 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所  甘肃省牦牛繁育重点实验室 

母体文献 中国草食动物科学 

年卷期 2018年03期

年份 2018 

分类号 S823.85 

关键词 牦牛  不饱和脂肪酸合成酶  基因克隆  生物信息学分析 

文摘内容 为研究牦牛硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD)基因的生物学功能,以正在培育的无角牦牛新品种为研究材料,设计引物对其SCD基因的CDS区进行基因克隆,并利用EMBOSS等程序进行生物信息学分析。结果表明:无角牦牛SCD基因CDS区长度为1 080 bp,蛋白编码359个氨基酸残基;相比普通牛,无角牦牛新品种SCD基因的扩增片段共检测出7个碱基差异,分别为1次A颠换为C、2次C颠换为A、1次A转换G、2次C转换T、1次T颠换为A;对氨基酸序列比对发现,仅第1、第6、第7处的差异使得对应的氨基酸发生变化;牦牛SCD基因编码蛋白的分子式为C1922H2912N506O514S11,分子量约41.7 k D,理论等电点(p I)为9.23,消光系数83 895,不稳定系数44.41,疏水指数86.96,平均亲水性-0.235,属不稳定可溶性碱性蛋白质,在哺乳动物网织红细胞内的半衰期30 h;牦牛SCD基因编码蛋白的二级结构由α螺旋、β折叠、延伸链以及随机卷曲结构构成;该蛋白也具有低复杂结构以及跨膜结构。