牦牛MSMB基因的克隆及其生物信息学分析

编号 zgly0001683174

文献类型 期刊论文

文献题名 牦牛MSMB基因的克隆及其生物信息学分析

作者 刘宇  何向东  夏忆  陈莹  字向东 

作者单位 西南民族大学动物科学国家民委重点实验室 

母体文献 中国草食动物科学 

年卷期 2019年05期

年份 2019 

分类号 S823.85 

关键词 牦牛  MSMB基因  基因克隆  生物信息学分析 

文摘内容 微精原蛋白β(MSMB)对动物的繁殖功能具有重要的调控作用。采集成年健康母牦牛的卵巢组织,通过RT-PCR技术克隆牦牛的MSMB基因,并进行了生物信息学分析。结果表明:牦牛MSMB基因CDS区长117 bp,编码38个氨基酸;MSMB蛋白分子式C194H308N50O59S4,理论等电点7.69,分子质量4.4 ku,脂肪系数66.58,不稳定系数21.23,属于稳定蛋白质,半衰期30 h,不具有跨膜结构和信号肽,是亲水性蛋白;与黄牛MSMB基因对比发现,牦牛MSMB基因存在1处碱基突变;牦牛与黄牛和绵羊CDS区核苷酸同源性均在80%以上,说明MSMB基因在进化中保守;MEGA 6.0和Clustal X软件分析结果表明,牦牛与黄牛首先聚为一小类,其次与绵羊、小鼠和大鼠聚为一类,最终与猪、鸡和鱼聚为一类,符合物种进化规律,进化树与同源性比对结果相符;二级结构α螺旋、延长链、β-转角和无规卷曲,分别占13.16%、44.74%、13.16%、28.95%,二级结构与三级结构相符;预测MSMB蛋白其结构域是PSP94超家族成员。该实验结果为进一步研究牦牛MSMB基因功能提供了一定理论依据。