杜仲转录组微卫星特征分析

编号 zgly0001531454

文献类型 期刊论文

文献题名 杜仲转录组微卫星特征分析

作者 申响保  闫文德  梁小翠  孙志强 

作者单位 中南林业科技大学林学院  中南林业科技大学南方林业生态应用技术国家工程实验室  国家林业局泡桐研究开发中心 

母体文献 经济林研究 

年卷期 2016年04期

年份 2016 

分类号 S792.99 

关键词 杜仲  转录组  微卫星 

文摘内容 为给杜仲SSR分子标记的选择提供参考依据,利用MISA软件对杜仲转录组序列进行了微卫星查找,共获得重复单元长度为1~6碱基的29 067个微卫星序列。分析这些微卫星序列后发现,在杜仲转录组中,长度为二核苷酸的微卫星重复单元最为丰富,占43.7%;在单碱基重复和二碱基重复这两种类型中,最主要的优势重复单元分别是A/T和AG/CT;在三碱基、四碱基、五碱基重复类型中,(AAN)n、(ANAT)n、(AANAN)n分别为其对应的优势重复单元。杜仲转录组中,微卫星的频率随着微卫星总长度的增加而降低。