香石竹斑驳病毒(CarMV)主要基因的分子变异分析

编号 zgly0001420369

文献类型 期刊论文

文献题名 香石竹斑驳病毒(CarMV)主要基因的分子变异分析

作者 佟爱仔  孔宝华  陈海如  王连春  胡中会  李晓鹏  蔡红 

作者单位 云南农业大学植物保护学院  云南农业大学农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室 

母体文献 植物病理学报 

年卷期 2012年01期

年份 2012 

分类号 S436.8 

关键词 香石竹斑驳病毒  p7  p9  CP  分子变异 

文摘内容 香石竹斑驳病毒(Carnation mottle virus,CarMV)是侵染香石竹的主要病毒之一。本试验从12个香石竹品种中获得CarMV分离物,通过RT-PCR扩增包含p7、p9、CP 3个主要基因的片段,并对扩增产物进行克隆测序。通过序列比对发现CarMV的p7、p9、CP 3个基因有较高的稳定性,p7基因核苷酸序列相似性为98.10%,氨基酸序列相似性为97.81%,其中氨基酸的第11和14位存在显著差异;p9基因核苷酸序列的相似性为98.80%,氨基酸序列相似性为99.13%,氨基酸序列在第4位差异明显;CP基因核酸序列相似性为97.58%,氨基酸的相似性为98.43%,氨基酸序列的第164和331位的变异存在相关性,整个CP变异位点比较分散。证实p7和p9的变异位点主要集中在暴露与寄主互作相关的N端,推测这是导致病毒变异,与寄主互作变异的重要位点。