班皮桉及其近邻树种CCR基因分子变异分析

编号 zgly0000406101

文献类型 期刊论文

文献题名 班皮桉及其近邻树种CCR基因分子变异分析

学科分类 220.99;林学其他学科

作者 陈碧华  Merv Shepherd  梁一池 

作者单位 福建农林大学林学院  福建省林业科学研究院  Southern Cross University 

母体文献 西南林学院学报 

年卷期 2006,26(5)

页码 1-5

年份 2006 

分类号 S792.390.1 

关键词 伞房属(哥伦比亚属)  班皮桉  肉桂酰辅酶A还原酶  分子变异  系统进化树 

文摘内容 选取伞房属班皮桉及其近邻树种共5部类16个样本提取基因组DNA, 用2对引物进行PCR扩增, 采用凝胶直接纯化。改进测序反应后测序。以Eucalyptus gunnii CCR作对照。通过ClustalW进行比对分析序列变异和MEGA3进行系统进化分析。结果显示: 在所得到的伞房属16个样本CCR序列中, A, C, G和T4种核苷酸所占比例分别为24.92%, 23.18%, 23.22%和28.67%, A+T含量明显高于G+C.共发现292个变异位点, 占分析位点总数的9.71%, 变异除118个转换和97个颠换外, 有93个位点的插入/缺失, 其中简约信息位点185个, 占63.36%.部分变异位点重叠。转换与颠换比值为1.22: 1.00.CCR系统发育树显示: E.gunnii是一个单独分枝, 5部类亲缘可以分辨开来, Rufaria尤其明显。Rufaria最早产生分歧, 其次是Ochraria和Cadagaria,Blakearia分歧属最迟进化。