建兰花叶病毒外壳蛋白基因和3′UTR序列测定与分析

编号 zgly0001445623

文献类型 期刊论文

文献题名 建兰花叶病毒外壳蛋白基因和3′UTR序列测定与分析

作者 郑国华  苏勇波  郑志忠  彭德伟  明艳林 

作者单位 厦门华侨亚热带植物引种园国家农作物  国外引种隔离检疫基地  厦门市引种检疫与植物源产物重点实验室  厦门兆翔花卉科技有限公司 

母体文献 植物保护 

年卷期 2013年02期

年份 2013 

分类号 S436.8 

关键词 建兰花叶病毒  外壳蛋白基因  3′非编码区  分子变异 

文摘内容 采用单链构象多态性分析从建兰花叶病毒(Cymbidium mosaic virus,CyMV)的8个分离物筛选得到5个存在遗传变异的分离物,并测定了外壳蛋白(coat protein,CP)基因和3′非编码区(3′UTR)序列,经序列分析表明5个分离物与其他分离物间的CP核苷酸和氨基酸序列相似性分别为87.1%～99.9%和91.1%～99.6%,属于亚组A成员。CP基因不同片段受到正选择压力的作用不一样,C端受到负选择压力的作用不易发生变异,而N端受到正选择压力的作用容易发生变异。通过RNAsharpes软件分析3′UTR序列发现各分离物均形成带有Potexvirus属保守核苷酸序列AC(C/T)TAA的三叶草茎环结构,这种结构的功能可能与病毒RNA复制有关。