甜菜西方黄化病毒两个山东辣椒分离物全基因组扩增及序列分析

编号 zgly0001719781

文献类型 期刊论文

文献题名 甜菜西方黄化病毒两个山东辣椒分离物全基因组扩增及序列分析

作者 臧连毅  刘晓莹  孙晓辉  张先平  周涛  竺晓平 

作者单位 山东农业大学植物保护学院山东省果蔬优质高效生产协同创新中心  中国农业大学植物保护学院 

母体文献 植物病理学报 

年卷期 2020年05期

年份 2020 

分类号 S432.41 

关键词 甜菜西方黄化病毒  全基因组  系统进化树  辣椒  病毒病 

文摘内容 通过RACE和RT-PCR技术相结合的方法,在山东省潍坊市和济宁市辣椒上克隆出2个甜菜西方黄化病毒(beet western yellows virus,BWYV)的全基因组序列,基因组全长均为5 699 nt。与GenBank比对发现,2个分离物的5′UTR(Untranslated region,UTR)变异程度小、相对比较保守,而3′UTR变异程度大、为突变热点区域。潍坊、济宁两地分离物与GenBank中该病毒的全基因组序列相似度平均值分别为89.89%和89.72%。系统进化树分析发现BWYV亚洲地区的分离物聚类在3个不同的组别,本研究克隆的2个山东分离物和3个日本分离物(LC428355、LC428356、LC428357)、2个韩国分离物(LC198684、KM076647)聚在一组,而美国分离物与法国分离物聚在其他分支,表明该病毒的进化存在地理相关性。这是首次对BWYV中国辣椒分离物的全基因组序列克隆,丰富了BWYV的序列信息,有助于进一步了解该病毒种群的遗传进化关系。