甘蔗线条花叶病毒HC-Pro基因的分子变异分析

编号 zgly0001545015

文献类型 期刊论文

文献题名 甘蔗线条花叶病毒HC-Pro基因的分子变异分析

作者 贺振  李文凤  张志想  李世访 

作者单位 扬州大学园艺与植物保护学院  中国农业科学院植物保护研究所/植物病虫害生物学国家重点实验室  云南省农业科学院甘蔗研究所/云南省甘蔗遗传改良重点实验室 

母体文献 植物保护 

年卷期 2017年02期

年份 2017 

分类号 S435.661 

关键词 甘蔗线条花叶病毒  HC-Pro基因  分子变异 

文摘内容 为了解析甘蔗线条花叶病毒Sugarcane streak mosaic virus(SCSMV)不同分离物HC-Pro基因的分子变异规律,本研究利用RT-PCR法扩增获得SCSMV HC-Pro基因的序列,通过生物信息学分析,分别从重组、系统发生、选择压力等方面研究SCSMV HC-Pro基因的分子变异特征。共测定了44条SCSMV HC-Pro基因序列,相似性最低值为70%;HC-Pro基因重组频率较低,仅发现3个重组位点,其中一个系首次报道;与先前报道相比,部分新测定云南蔗区的SCSMV分离物在HC-Pro基因上形成一个新组-第Ⅲ组;HC-Pro基因处于很强的负选择压力作用,未发现正向选择作用位点。本研究结果进一步证明SCSMV HC-Pro基因具有高度的遗传多样性。