基于转录组的沙棘木蠹蛾简单重复序列特征分析

编号 zgly0001539770

文献类型 期刊论文

文献题名 基于转录组的沙棘木蠹蛾简单重复序列特征分析

作者 崔明明  陶静  宗世祥 

作者单位 北京林业大学林木有害生物防治北京市重点实验室 

母体文献 环境昆虫学报 

年卷期 2017年03期

年份 2017 

分类号 S763.7 

关键词 沙棘木蠹蛾  转录组  微卫星 

文摘内容 为开发沙棘木蠹蛾微卫星信息,利用已获得的转录组数据,对其EST-SSR位点进行发掘,进而分析其特征。结果发现含SSR的序列5126条,识别的SSR总数为7499个,SSR出现频率为51.41%。微卫星序列主要以单碱基重复为主,发生频率为39.52%。研究共发现77种碱基重复基元,所占比例最高的为(A/T)n(73.74%),其次是(AT/AT)n(3.37%)。微卫星多为重复次数为10且长度为10 bp的短序列。研究结果为沙棘木蠹蛾的SSR分子标记研究,遗传多样性分析,种群遗传结构以及关键性状基因的发掘等研究奠定基础。