梨小食心虫幼虫中肠转录组及SSR分子标记分析

编号 zgly0001655374

文献类型 期刊论文

文献题名 梨小食心虫幼虫中肠转录组及SSR分子标记分析

作者 冷春蒙  李引  胡迪  仵均祥  李怡萍 

作者单位 西北农林科技大学植物保护学院植保资源与病虫害治理教育部重点实验室  西北农林科技大学植物保护学院农业部西北黄土高原作物有害生物综合治理重点实验室 

母体文献 昆虫学报 

年卷期 2018年11期

年份 2018 

分类号 S433.4 

关键词 梨小食心虫  中肠  转录组  SSR  分子标记  IlluminaHiSeq 

文摘内容 【目的】梨小食心虫Grapholitha molesta是一种重要的世界性果树害虫。昆虫中肠在食物消化、免疫反应、生长发育等方面发挥着重要作用。本研究旨在建立梨小食心虫幼虫中肠转录组数据库,挖掘其基因信息。【方法】利用高通量测序平台(Illumina HiSeq X Ten)对梨小食心虫幼虫中肠进行转录组测序、组装及生物信息学分析;进而利用转录组数据进行梨小食心虫幼虫中肠SSR分子标记鉴定。【结果】总计获得梨小食心虫幼虫中肠转录组96 419条unigenes,与公共数据库比对,共注释到57 300条unigenes。通过GO数据库注释,将unigenes的功能分为生物学进程、细胞组分和分子功能三大类55个功能区,其中参与细胞进程、细胞和细胞组分及结合功能的unigenes比例较大。KOG结果显示,10 090条unigenes归到25个基因家族,注释到一般功能预测的最多。KEGG数据库中,10 250条序列注释到232个代谢通路,注释到核糖体的基因数最多。此外,用MISH软件,在10 600条unigenes中搜索到12 690个SSR位点,通过PCR开发出6个SSR位点。【结论】本研究成功组装梨小食心虫幼虫中肠参考转录组,为以中肠为靶标的害虫防治提供理论依据。