虎眼万年青鳞茎转录组特性分析

编号 zgly0001496270

文献类型 期刊论文

文献题名 虎眼万年青鳞茎转录组特性分析

作者 姜福星  江欣燕  吴生  杨丽娟  李文骥  陈其兵 

作者单位 四川农业大学园林研究所  广东虎眼万年青种植场 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2015年09期

年份 2015 

分类号 S567.239 

关键词 虎眼万年青  鳞茎  转录组测序  特性分析 

文摘内容 虎眼万年青具有很高的药用价值和经济价值,鳞茎是其主要的药用和繁殖器官,然而虎眼万年青鳞茎的分子生物学信息严重缺乏成为制约其研究生产的瓶颈。为获得虎眼万年青鳞茎的转录组信息,应用高通量测序技术对虎眼万年青鳞茎进行测序分析。采用His4000测序平台共获得8.2 G原始数据,经过整理分析后,获得7.6 G有效数据和121 223条Unigene;经过与NR、GO、COG及KEGG等数据库进行比较分析后,56 374条Unigene获得NR数据库的注释,39 263条Unigene获得GO数据库的注释,12 388条Unigene获得COG功能注释,5 405条Unigene参与了新陈代谢途径,2 477条Unigene参与了次生代谢途径,166条Unigene参与了萜类的合成,195条Unigene参与了生物碱的合成,295条Unigene作为转录因子参与新陈代谢过程调控。研究结果为采用生物技术手段提高虎眼万年青的药用成分的含量及改善其园艺性状提供了分子数据。