西文蜜蜂LOC724521基因座的cDNA序列克隆及TSS的分析

编号 zgly0000700818

文献类型 期刊论文

文献题名 西文蜜蜂LOC724521基因座的cDNA序列克隆及TSS的分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 孙亮先  黄周英  �� 

作者单位 泉州师范学院分子生物学与药物化学福建省高等学校重点实验室  国家人类基因组南方研究中心 

母体文献 泉州师范学院学报 

年卷期 2010,28(4)

页码 42-46

年份 2010 

分类号 Q963 

关键词 西方蜜蜂  5’LongSAGE  转录起始位点(TSS)  RT-PCR  cDNA 

文摘内容 5’LongSAGE标签得自于全长mRNA分子的5’末端的前19 nt.该研究利用定位在西方蜜蜂基因组中的一个预测基因座LOC724521的2条5’LongSAGE标签序列作为5’引物,通过RT-PCR克隆了该预测基因座的2条长335 bp和337 bp的cDNA序列(GenBank登录号: GU358205,GU358204).此cDNA编码一条长88个氨基酸残基的多肽.用所克隆的cDNA序列对基因座LOC724521进行功能注释发现,该基因含有3个外显子和2个＂GT-AG＂型内含子.5’LongSAGE标签序列的基因组定位结果显示: 基因座LOC724521在雄蜂的头部中表达丰度很高,RNA PolⅡ可从5个转录起始位点(TSS)上以不同效率起始转录,该基因的59%和31%的转录是从2个优势TSS上起始.有趣的是,有一条5’LongSAGE标签序列被定位在内含子区,暗示该基因存在外显子的可变性选择现象.该研究结果不仅在转录水平上证实了软件预测的基因座LOC724521确实存在,同时揭示了该基因存在可变性转录起始位点和可变性外显子选择等转录调控机制.