西方蜜蜂表皮蛋白基因apd-like转录起始位点的定位及cDNA序列的分析

编号 zgly0001410066

文献类型 期刊论文

文献题名 西方蜜蜂表皮蛋白基因apd-like转录起始位点的定位及cDNA序列的分析

作者 孙亮先  黄周英  郑华军  游燕琳 

作者单位 泉州师范学院分子生物学与药物化学福建省高等学校重点实验室  国家人类基因组南方研究中心 

母体文献 昆虫学报 

年卷期 2011年02期

年份 2011 

分类号 Q966 

关键词 西方蜜蜂  5′LongSAGE  表皮蛋白  apd-like基因  转录起始位点(TSS) 

文摘内容 Apidermin蛋白家族是根据蜜蜂表皮蛋白apidermin1-3(APD1-3)而命名的一个新型的昆虫结构性表皮蛋白家族。为了鉴定西方蜜蜂Apis mellifera基因组序列上毗邻基因簇apd1-3的一个预测基因座LOC727145是否为一个新的apd基因,本研究在用5′LongSAGE标签定位该基因的转录起始位点(TSS)的基础上,利用其中的3条5′LongSAGE标签序列作为上游引物,通过RT-PCR方法克隆了该基因的cDNA序列(GenBank登录号:GU358197,GU358199,GU358198)。生物信息学分析发现,基因座LOC727145含有2个外显子和1个GT-AG型内含子,其cDNA序列富含GC(70%),可编码一条长152aa残基的高度疏水性多肽。此多肽序列的氨基酸组成与蜜蜂APD1-3表皮蛋白类似,富含Ala,Gly,Pro,Leu和Val5种氨基酸(占77%),其中Ala残基含量最高(29%)。该多肽序列与蜜蜂APD-1表皮蛋白序列的相似性为50%,且其N末端的预测信号肽序列与APD蛋白的信号肽序列类似。5′LongSAGE标签的基因组定位结果显示,基因座LOC727145在雄蜂头部中表达丰度很高,RNA PolⅡ可从6个不同的TSS上以不同效率起始转录,其中由一个优势TSS上起始了90%的转录。本研究为apidermin表皮蛋白家族增添了一个新成员,命名为apidermin-like(apd-like)。