四川地区猕猴桃病毒1的RT-PCR检测及外壳蛋白基因序列分析

编号 zgly0001693176

文献类型 期刊论文

文献题名 四川地区猕猴桃病毒1的RT-PCR检测及外壳蛋白基因序列分析

作者 彭期定  吕蕊  杨婷  林宏辉  席德慧 

作者单位 四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2020年01期

年份 2020 

分类号 S436.634 

关键词 猕猴桃  猕猴桃病毒1  RT-PCR  CP基因  分子特征 

文摘内容 为了明确近期新西兰报道的侵染猕猴桃的新病毒——猕猴桃病毒1(Actinidia virus 1,AcV-1)在四川地区猕猴桃上的发生情况及其分子特性,采用RT-PCR对来自四川6个地区疑似感染病毒的90份猕猴桃主栽品种‘红阳’和‘金果’的叶片样品进行检测。结果表明,22份样品为AcV-1阳性,检出率为24.4%。将获得的5个AcV-1分离物和已报道的新西兰分离物K75的外壳蛋白(coatprotein,CP)基因序列进行比对,结果表明,分离物间核苷酸序列和氨基酸序列的相似性分别为84.8%～97.1%和89.7%～99.6%,其中除邛崃分离物HYH5与新西兰分离物K75的核苷酸序列相似性较高(97.1%)外,其余4个分离物均低于91%。系统进化分析结果显示,这些分离物主要聚集在3个分支上,分离物HYH5与新西兰分离物K75位于同一分支,其余分离物位于另外2个分支。