猕猴桃病毒A和B的RT-PCR检测及分子变异初步研究

编号 zgly0001485346

文献类型 期刊论文

文献题名 猕猴桃病毒A和B的RT-PCR检测及分子变异初步研究

作者 郑亚洲  王国平  周菊芳  朱晨熹  王利平  徐文兴  洪霓 

作者单位 华中农业大学植物科技学院湖北省作物病害监测与安全控制重点实验室  农业微生物学国家重点实验室 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2015年04期

年份 2015 

分类号 S436.634.1 

关键词 猕猴桃  猕猴桃病毒A  猕猴桃病毒B  RT-PCR  序列分析 

文摘内容 为明确猕猴桃病毒A(Actinidia virus A,Ac VA)和猕猴桃病毒B(Actinidia virus B,Ac VB)在中国猕猴桃(Actinidia sp.)上的侵染状况和分子特性,采用RT-PCR技术对151份猕猴桃样品的Ac VA和Ac VB进行检测,检出率分别为15.2%和17.9%,所收集的6种猕猴桃样品中均检测到一种或两种病毒。发现Ac VA的ORF1、ORF4和ORF5扩增片段序列存在较大分子变异,不同分离物的269 bp片段(ORF1)核苷酸序列相似性为77.3%~99.3%。在基于各扩增片段核苷酸序列的系统进化树中,Ac VA分离物聚为2~3组。采用引物Ac VB5F/5R扩增获得20个Ac VB分离物的342 bp或338 bp的ORF5片段,核苷酸序列相似性为81%~100%,与新西兰Ac VB分离物TP7-93B相应片段的核苷酸序列相似性为83.9%~99.7%,在系统进化树中聚为3组。