牛支原体分离株全基因组序列测定及初步分析

编号 zgly0001469617

文献类型 期刊论文

文献题名 牛支原体分离株全基因组序列测定及初步分析

作者 王艳杰  李平安  吴太平  关平原 

作者单位 内蒙古农业大学兽医学院农业部动物临床诊疗技术重点实验室  内蒙古农业大学食品科学与工程学院 

母体文献 动物医学进展 

年卷期 2014年08期

年份 2014 

分类号 S852.62 

关键词 牛支原体  酚-氯仿提取法  全基因组测序 

文摘内容 为全面了解牛支原体NM2012株的基因序列,研究其潜在的致病机制及其复制、转录、翻译过程的调控机制,采用体外大量培养,酚-氯仿法提取牛支原体NM2012株基因组DNA,并送往北京华大基因公司进行全基因组测序注释。结果显示,牛支原体NM2012株基因组大小为993 483bp,GC含量为29.26%,测序组装后共产生3个scaffolds,24个contigs。基因组组分分析后发现,NM2012株的基因组含有885个基因,总长度为834 042bp,基因平均长度为942bp,占基因组全长的83.95%。串联重复序列共79个,总长为9 203bp,占基因组全长的0.926 3%。小卫星序列53个,微卫星序列5个,tRNA 34个,rRNA 4个。牛支原体NM2012株16SrRNA序列与支原体属致牛羊病主要菌株构建进化树进一步证实NM2012株为牛支原体,为后期进一步研究牛支原体提供依据。