吉林地区高致病性PRRSVJL-04/12株的分离鉴定与全基因组测序

编号 zgly0000823839

文献类型 期刊论文

文献题名 吉林地区高致病性PRRSVJL-04/12株的分离鉴定与全基因组测序

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 王凤雪  郭利  温永俊  宋妮  杨艳玲  张淑琴  谭斌  武华 

作者单位 中国农业科学院特产研究所吉林省特种经济动物分子生物学重点实验室 

母体文献 西北农林科技大学学报: 自然科学版 

年卷期 2013(4)

页码 37-44

年份 2013 

分类号 S852.659.2 

关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒  分离鉴定  全基因组测序 

文摘内容 【目的】:确定吉林省某疑似高致病性PRRS猪场的病原, 研究其基因特性。【方法】:采集疑似感染高致病性PRRSV病猪的脏器组织, 处理后接种MARC-145细胞, 观察细胞病变, 分离PRRSV; 应用RT—PCR方法检测和确定分离毒株的基因型, 采用间接免疫荧光、电镜观察和全基因组测序检测分离的病毒。【结果】:分离毒株为北美洲型PRRSV, 命名为JL-04/12, 其基因组全长为15320bp(不包括PolyA), 可使MARC-145细胞产生典型的细胞病变。序列比对结果表明: JL-04/12株与经典毒株VR2332和CH—1a的核苷酸同源性分别为89.5%和94.9%; 与高致病性毒株JXA1、HUN4的核苷酸同源性为99.1%。分离毒株JL-04/12编码的2个非结构蛋白和GP2GP4的氨基酸序列与HUN4株同源性较高, 在97.2%～99.3%, 而JL-04/12编码的GP5的氨基酸序列与JXA1株同源性较高, 为98.5%; JL-04/12编码的GP6和N蛋白的氨基酸序列与高致病性PRRSV毒株JXA1和HUN4的同源性均为100%。PRRSVJ1704/12株的Nsp2不连续缺失30个氨基酸, 与高致病性PRRSV毒株JXA1和HUN4的同源性最高, 均为97.8%, 判定该分离株为变异的高致病性PRRSV。【结论】:从吉林省分离到1株高致病性PRRSV, 说明高致病性PRRS变异病毒在吉林省仍然存在。