牛Dmrt7基因cDNA的克隆和生物信息学分析

编号 zgly0000556681

文献类型 期刊论文

文献题名 牛Dmrt7基因cDNA的克隆和生物信息学分析

作者 淮亚红  许尚忠  姬爱国  王淑辉  高雪  陈金宝  任红艳 

作者单位 西北农林科技大学动物科技学院  中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 

母体文献 西北农林科技大学学报 

年卷期 2008,36(3)

页码 13-17,24

年份 2008 

分类号 S823.81 

关键词 牛  Dmrt7基因  cDNA  克隆  生物信息 

文摘内容 【目的】探讨牛Dmrt7基因的生物学功能,为进一步研究该基因对牛精液品质的影响奠定基础。【方法】以牛睾丸组织为材料,根据GenBank中发表的小鼠Dmrt7基因序列,结合生物信息学技术,设计并合成2对引物,采用RT-PCR方法克隆牛Dmrt7 cDNA,并运用DNAMAN软件及在线工具对所得到的序列进行了生物信息学分析。采集牛肾脏、肝脏、睾丸、肺、脾脏、瘤胃、子宫、小肠、心脏、卵巢和肌肉等11个组织,以牛-βactin基因为内参基因,对牛Dmrt7基因的组织表达谱进行分析。【结果】牛Dmrt7基因cDNA长度为1 378 bp(Genbank登录号为EF534775),包含由1 113个碱基组成的开放读码框(ORF),该ORF包含1个TAG终止密码子,编码370个氨基酸；在进化关系上,牛首先与狗聚为一类,亲缘关系最近,再与小鼠和大鼠聚为一类,最后与人和短尾猿聚为一类。Dmrt7蛋白含有一个DM结构域。牛Dmrt7基因在睾丸组织中高度表达,在其他组织中不表达。【结论】获得了牛Dmrt7基因的cDNA序列(Genband登录号为EF534775)；牛Dmrt7蛋白可能对精液品质有影响。