草莓应答炭疽菌侵染的转录组分析

编号 zgly0001704096

文献类型 期刊论文

文献题名 草莓应答炭疽菌侵染的转录组分析

作者 陈哲  黄静  赵佳  梁宏 

作者单位 山西省农业科学院生物技术研究中心 

母体文献 植物保护 

年卷期 2020年03期

年份 2020 

分类号 S436.68 

关键词 草莓  炭疽菌  转录组分析  差异表达基因 

文摘内容 本研究以栽培草莓为材料,用炭疽菌对植株进行侵染,对健康草莓和患病草莓进行转录组分析(RNA-seq),共得到86 988个序列以及2 127个差异表达基因。利用GO数据库对差异表达基因进行了聚类分析,结果发现差异表达基因主要聚类在光合作用、氧化还原过程、氧化还原酶活性、碳固定过程以及糖代谢过程等方面。同时,利用KEGG数据库对差异表达基因影响的通路进行注释后发现,炭疽菌侵染主要影响了光合作用、倍半萜和三萜生物途径、类黄酮生物合成、谷胱甘肽代谢和植物激素信号转导等途径中关键基因的表达水平。挑选了20个差异表达基因进行qRT-PCR,结果有19个基因的表达趋势与转录测序结果一致。本研究获得的草莓应答炭疽菌侵染转录组数据信息,将有助于丰富草莓抗炭疽病的调控机制。