NaCl胁迫下红砂种子萌动期差异表达基因的转录组分析

编号 zgly0001667339

文献类型 期刊论文

文献题名 NaCl胁迫下红砂种子萌动期差异表达基因的转录组分析

作者 刘晓威  杨秀艳  武海雯  刘肖艳  朱建峰  张华新 

作者单位 国家林业和草原局盐碱地研究中心  河南农业大学生命科学学院 

母体文献 南京林业大学学报(自然科学版 

年卷期 2019年03期

年份 2019 

分类号 S793.9 

关键词 红砂  NaCl胁迫  种子萌发  差异表达基因  转录组分析 

文摘内容 【目的】筛选NaCl胁迫下红砂萌发期的差异表达基因,为耐盐碱树种选育提供基因资源。【方法】以前期拟合的萌发阈值浓度(273 mmol/L,记为M)、最适萌发浓度(43 mmol/L,记为L)、蒸馏水(记为C)处理红砂种子,每个处理3次重复,待胚根突破种皮,不超过2 mm时取出,进行转录组测序。【结果】分别在L与C对比组(记为LvsC)、M与C对比组(记为MvsC)、M与L对比组(记为MvsL)中筛选出210、2 273、2 888个差异表达基因,其中LvsC中116个上调表达,94个下调表达;MvsC中1 781个上调表达,492个下调表达; MvsL中2 165个上调表达,723个下调表达;上调表达基因在KEGG富集中主要集中在核糖体、碳代谢、细胞色素P450代谢、谷胱甘肽代谢等途径,下调表达基因主要富集在蔗糖淀粉代谢、内质网蛋白质加工等过程。【结论】盐胁迫条件下,差异基因诱导相关反应协同发挥作用,最终使胚轴细胞伸长,突破种皮完成萌发。