基于转录组测序的慈竹笋木质素基因筛选及其表达分析

编号 zgly0001648647

文献类型 期刊论文

文献题名 基于转录组测序的慈竹笋木质素基因筛选及其表达分析

作者 蒋海港  王树刚  刘阳  沈彦合  李祥宁  曹颖 

作者单位 西南科技大学生命科学与工程学院 

母体文献 植物研究 

年卷期 2018年03期

年份 2018 

分类号 S795.5 

关键词 慈竹  笋  木质素生物合成  差异表达 

文摘内容 慈竹(Bambusa emeiensis)纤维素含量丰富,是较好的造纸原料,但竹茎中木质素影响着制浆生产及纸浆质量。目前,对慈竹木质素生物合成机制所知甚少,这限制了遗传调控竹木质素的研究。本文以拟南芥、水稻等植物的已知木质素基因作为查询序列,通过BLASTp和系统进化分析,从10、50、100和150 cm慈竹笋转录组数据中筛选到351个木质素生物合成相关Unigenes,包括51个LAC,37个4CL、26个PAL、34个CCR和25个CAD相关转录子,其数量高于其他已报道的竹类植物。转录丰度和定量基因表达分析发现16个木质素基因,包括2个PAL、5个CCR、3个4CL、2个CADH2和4个LAC,随着笋发育而表达上调,表明其可能与发育性木质素积累相关。