基于茶蛋白质组学数据分析植物亚细胞定位预测软件的应用

编号 zgly0001721141

文献类型 期刊论文

文献题名 基于茶蛋白质组学数据分析植物亚细胞定位预测软件的应用

作者 刘艳丽  周媛  曹丹  马林龙  龚自明  金孝芳 

作者单位 湖北省农业科学院果树茶叶研究所  中国科学院武汉植物园 

母体文献 植物科学学报 

年卷期 2020年05期

年份 2020 

分类号 S571.1 

关键词 茶  蛋白质  亚细胞定位  预测 

文摘内容 以500个茶(Camellia sinensis (L.) O. Ktze.)叶片的蛋白质作为数据集,比较TargetP、WoLF PSORT、LocTree和Plant-mPLoc 4种软件预测亚细胞定位的可信度和灵敏度。结果显示,4种软件预测可信度均高于80%,依次排序为TargetP> LocTree> WoLF PSORT> Plant-mPLoc。其中,LocTree对细胞质蛋白和分泌蛋白检测灵敏度最高,但对叶绿体蛋白灵敏度最低; Plant-mPLoc检测核蛋白最灵敏,但对细胞质蛋白最不敏感;TargetP检测叶绿体蛋白最灵敏,但仅能区分3个亚细胞器官; WoLF PSORT对分泌蛋白检测灵敏度最低,但对其他蛋白均较灵敏。基于上述结果,该研究针对4种软件提出了合理的使用建议。