杨树蛋白质二级结构的人工神经网络预测

编号 zgly0000890110

文献类型 期刊论文

文献题名 杨树蛋白质二级结构的人工神经网络预测

作者 高光芹  孟庆玲  黄家荣 

作者单位 河南农业大学 

母体文献 西北林学院学报 

年卷期 2014(5)

页码 59-63+69

年份 2014 

关键词 杨树  蛋白质  二级结构  人工神经网络  预测 

文摘内容 以PDB公用生物信息数据库为基础,用人工神经网络建模技术对杨树蛋白质二级结构预测模型进行了研究,这对深入认识森林动态机理、提高森林资源信息化管理水平、改进森林保护制药设计等具有重要的应用价值,对森林生物学、森林生物信息学的研究具有重要的学术意义。从公用数据库下载杨树蛋白质样本27个,提取氨基酸2 947个。用长度为17的滑动窗口截取蛋白质一级结构的氨基酸序列片段,并用[-1,1]编码方式进行编码,以组织输入向量,以片段中心氨基酸对应的蛋白质二级结构(螺旋、折叠、无规则卷曲)为输出向量,构建了结构为17∶S∶3的BP人工神经网络模型。