青藏高原特有种—藏扇穗茅叶绿体基因组测序及序列分析

编号 zgly0001648616

文献类型 期刊论文

文献题名 青藏高原特有种—藏扇穗茅叶绿体基因组测序及序列分析

作者 刘玉萍  吕婷  朱迪  周勇辉  刘涛  苏旭 

作者单位 青海师范大学生命科学学院  青海省青藏高原药用动植物资源重点实验室  青海省自然地理与环境过程重点实验室  青藏高原环境与资源教育部重点实验室 

母体文献 植物研究 

年卷期 2018年04期

年份 2018 

分类号 Q943.2 

关键词 禾本科  扇穗茅属  藏扇穗茅  叶绿体基因组  Illumina测序  系统分析  青藏高原 

文摘内容 藏扇穗茅(Littledalea tibetica)是禾本科(Poaceae)雀麦族(Bromeae)中一个具有重要生态价值的多年生高山特有种,主要分布于青藏高原及其毗邻地区。本文采用基于第二代高通量测序平台的Illumina Mi Seq技术,对青藏高原特有种—藏扇穗茅进行了叶绿体基因组测序,首次建立了雀麦族物种的标准测序流程;同时,以其近缘物种—黑麦草(Lolium perenne)的叶绿体基因组序列作为参考,组装获得它的叶绿体基因组序列。结果表明,藏扇穗茅叶绿体基因组序列全长136 852 bp,GC含量为38.5%,呈典型的四段式结构,其中大(LSC)、小(SSC)单拷贝区大小分别为80 970和12 876 bp,反向互补重复区(IR)大小为21 503 bp,共注释得到141个基因,包含95个蛋白编码基因、38个tRNA基因和8个rRNA基因,主要分布于大单拷贝区和小单拷贝区。同时,基于藏扇穗茅和其它30种禾本科植物叶绿体基因全序列构建的系统发育树显示,藏扇穗茅与早熟禾亚科中小麦族植物亲缘关系较近。