辣椒轻斑驳病毒湖南分离物的全基因序列测定及结构分析

编号 zgly0001545009

文献类型 期刊论文

文献题名 辣椒轻斑驳病毒湖南分离物的全基因序列测定及结构分析

作者 刘湘宁  戴良英  李魏  董铮  唐前君 

作者单位 湖南农业大学植物保护学院  湖南省植物病虫害生物学与防控重点实验室  湖南农业大学病毒研究所 

母体文献 植物保护 

年卷期 2017年02期

年份 2017 

分类号 S432.41 

关键词 辣椒  辣椒轻斑驳病毒  全基因序列  序列分析 

文摘内容 采自湖南地区的辣椒轻斑驳病毒Pepper mild mottle virus(PMMoV)样品经单斑分离后,根据已经报道的PMMoV序列基因保守区设计6对简并引物,采用片段重叠法和RACE方法扩增、克隆获得一个全长为6 356bp的湖南分离物(PMMoV-HN1,登录号:KP345899)全基因组序列,编码4个蛋白,分别为126kD蛋白(70~3 423nt)、183kD蛋白(70~4 908nt)、28kD蛋白(4 909~5 682nt)和17.5kD蛋白(5 685~6 158nt),5′-非编码区(5′-UTR)和3′-非编码区(3′-UTR)分别含有69和198个碱基,其中5′-UTR存在一个序列为m7G5′pppG的甲基化核苷酸帽子结构。一致性分析发现PMMoV-HN1与PMMoV其他分离物的核酸一致性为94%~99%,编码的氨基酸一致性为94%~99%。全基因组序列系统进化分析表明PMMoV-HN1分离物与中国首次报道的PMMoV-CN分离物亲缘关系最近。本研究是国内报道的第二例PMMoV全基因组序列。