线粒体基因组数据的分析方法和软件

编号 zgly0001447826

文献类型 期刊论文

文献题名 线粒体基因组数据的分析方法和软件

作者 李雪娟  杨婧  王俊红  任倩俐  李霞  黄原 

作者单位 陕西师范大学生命科学学院 

母体文献 应用昆虫学报 

年卷期 2013年01期

年份 2013 

分类号 Q963 

关键词 线粒体基因组  拼接  注释 

文摘内容 线粒体基因组的研究已经普及,其正确的拼接和注释是所有后续研究的基础。本文以Staden Package软件为主介绍了拼接和注释的线粒体基因组的方法,同时介绍了其他常用的拼接软件ContigExpress、DNAMAN、DNASTAR、BioEdit和Sequencher,以及利用不同软件(包括DOGMA、MOSAS、MITOS、GOBASE、OGRe、MitoZoa、tRNAscan-SE、ARWEN、BLAST和MiTFi等)对线粒体基因组中的蛋白质编码基因、rRNA、tRNA和A+T富集区进行注释的方法,最后介绍了利用MEGA5软件分析线粒体基因组的组成、Sequin软件提交序列和线粒体基因组数据绘图工具(CG view、MTviz和OGDRAW)。