绿眼赛茧蜂线粒体基因组全序列测定和分析

编号 zgly0001720232

文献类型 期刊论文

文献题名 绿眼赛茧蜂线粒体基因组全序列测定和分析

作者 王丹阳  王予彤  于良斌  韩海斌  徐林波  崔艳伟  康爱国  庞红岩 

作者单位 中国农业科学院草原研究所  内蒙古农业大学  河北省张家口市康保县植保站 

母体文献 昆虫学报 

年卷期 2020年08期

年份 2020 

分类号 S476.3 

关键词 茧蜂科  优茧蜂亚科  绿眼赛茧蜂  线粒体基因组  系统发育 

文摘内容 【目的】测定绿眼赛茧蜂Zele chlorophthalmus线粒体基因组全序列,分析其基因组结构及茧蜂科（Braconidae）部分类群的系统发育关系。【方法】利用Illumina MiSeq二代测序技术对绿眼赛茧蜂的线粒体基因组进行测序,对基因组序列进行拼装、注释,分析其结构特点和碱基组成;基于22种茧蜂科昆虫的COX1蛋白编码基因序列,应用最大似然法（ML）和邻接法（NJ）构建系统发育树,分析绿眼赛茧蜂与茧蜂科其他昆虫的系统发育关系。【结果】绿眼赛茧蜂线粒体基因组全长16 661 bp（GenBank登录号:MG822749）,包含13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因和2个rRNA基因,共37个基因,以及1个控制区。线粒体基因组有明显的核苷酸组成的偏倚,AT偏正,GC偏负,其A+T含量为82.83%。基因排列顺序与推测的昆虫祖先的序列不完全一致,tRNA基因7处发生重排。13个蛋白质编码基因均以ATN为起始密码子,以TAA为终止密码子。在22个tRNA基因二级结构中,除tRNAHis（H）缺失TΨC环和tRNACys（C）仅剩二氢尿嘧啶（DHU）臂和反密码子臂外,其余tRNA基因均能形成典型的三叶草结构。基于COX1蛋白编码序列的系统发育分析结果显示,与绿眼赛茧蜂亲缘关系最近的是同属于赛茧蜂属的雪跗赛茧蜂Z.niveitarsis。【结论】本研究首次获得绿眼赛茧蜂线粒体基因组全序列。结果表明绿眼赛茧蜂隶属于优茧蜂亚科（Euphorinae）赛茧蜂属,并支持赛茧蜂属的单系性。