印度橄蝗线粒体基因组测定及系统发育分析

编号 zgly0001731525

文献类型 期刊论文

文献题名 印度橄蝗线粒体基因组测定及系统发育分析

作者 邱忠营  黄原  茹凝玉  崔媛媛 

作者单位 西安医学院基础医学部  陕西师范大学生命科学学院 

母体文献 广西林业科学 

年卷期 2020,49(4)

页码 471-479

年份 2020 

分类号 Q963 

关键词 线粒体基因组  印度橄蝗  瘤锥蝗科 

文摘内容 从分子水平分析印度橄蝗(Tagasta indica)与近缘昆虫的系统发生关系,采用一代PCR测序方法对印度橄蝗的线粒体基因组进行测序,对序列进行拼接、注释和特征分析,并利用线粒体基因组的13个蛋白编码基因(PCGs)和2个核糖体RNA(rRNAs)构建贝叶斯(BI)树。结果表明,印度橄蝗的线粒体基因组长度为15531 bp,包括13个PCGs、22个转运RNA(tRNAs)、2个rRNAs和1个控制区;线粒体基因排列紧凑,基因排序与祖先序列相同。线粒体蛋白编码基因中,除nad2、cox1和nad6为非标准起始密码子GTG、ACT和TTG外,其余均为标准起始密码子ATN;终止密码子中,除cox3为不完全终止密码子TA外,其余均为完整终止密码子TAA或TAG。线粒体的22个tRNAs中,除trnSAGN缺少DHU臂外,其余均为典型三叶草结构。错配方式主要为G-U错配。构建的贝叶斯树支持瘤锥蝗科(Chrotogonidae)的单系性。