细粒棘球蚴RTN4基因的克隆及序列分析

编号 zgly0001533142

文献类型 期刊论文

文献题名 细粒棘球蚴RTN4基因的克隆及序列分析

作者 刘田莉  孟庆玲  乔军  陈诚  马玉  胡政香  才学鹏  陈创夫 

作者单位 石河子大学动物科技学院  中国农业科学院兰州兽医研究所 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2016年03期

年份 2016 

分类号 S852.734 

关键词 细粒棘球蚴  抗原基因  基因克隆  生物信息学分析 

文摘内容 【目的】克隆细粒棘球蚴(Eg)内质网膜蛋白4(Reticulon-4,RTN4)抗原基因,对其序列进行生物信息学分析。【方法】采集感染Eg的绵羊肝脏和肺脏,提取Eg头节总RNA为模板,对RTN4基因进行RT-PCR扩增,将PCR产物克隆到pMD19-T载体后测序,对其核苷酸序列及氨基酸序列进行生物信息学分析。【结果】Eg RTN4cDNA全长654bp,编码217个氨基酸,蛋白质分子质量为25.3ku,等电点为8.83。编码氨基酸序列中含有1个N端酰基化位点、2个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点和4个蛋白激酶C磷酸化位点。经生物信息学软件预测,RTN4蛋白的抗原表位区主要集中在第1-47位、第71-147位和第171-217位区域;含有2个高度疏水区,2个跨膜区,膜外区分别位于第1-47位和第171-217位。【结论】成功克隆了Eg RTN4基因,预测了其编码蛋白抗原的结构和表位。