芜菁花叶病毒欧亚分离物HC-Pro基因的克隆和序列分析

编号 zgly0001321823

文献类型 期刊论文

文献题名 芜菁花叶病毒欧亚分离物HC-Pro基因的克隆和序列分析

作者 施曼玲 

作者单位 杭州师范大学生命与环境科学学院 杭州310036 

母体文献 植物病理学报 

年卷期 2007年04期

年份 2007 

分类号 S432.41 

关键词 芜菁花叶病毒  HC-Pro基因  序列分析 

文摘内容 16个芜菁花叶病毒(Turnip mosaic virus,TuMV)欧亚分离物分别来自奥地利、丹麦、德国、匈牙利、尼泊尔和英国6国。利用免疫捕获反转录PCR(Immunocapture RT-PCR,IC-RT-PCR)对16个分离物的HC-Pro(Helper component pro-teinase)基因进行PCR扩增,扩增产物克隆后进行序列测定,HC-Pro基因序列长度均为1374个核苷酸,编码458个氨基酸。16个分离物的HC-Pro基因核苷酸序列同源性为79.5%~99.8%,所编码的氨基酸同源性为94.1%~99.8%。对16个分离物及GenBank上已报道的其它14个TuMV的HC-Pro基因核苷酸的系统进化树分析表明:在16个TuMV欧亚分离物中,除了来自亚洲的分离物N23属Asian-BR组,其余15个来自欧洲的分离物都属于world-B组,其中分离物H1归属world-wide亚组,另外14个分离物则归属New World亚组。