球毛壳菌pdc基因克隆及生物信息学分析

编号 zgly0001350052

文献类型 期刊论文

文献题名 球毛壳菌pdc基因克隆及生物信息学分析

作者 张金栋  刘志华  杨谦  胡珅 

作者单位 哈尔滨工业大学  东宁出入境检验检疫局 

母体文献 东北林业大学学报 

年卷期 2009年03期

年份 2009 

分类号 Q933 

关键词 球毛壳菌  丙酮酸脱羧酶  基因克隆  生物信息学分析 

文摘内容 利用BlastX将球毛壳菌(Chaetomium globosum)ESTs序列与GenBank的Nr数据库进行相似性搜索,获得含有丙酮酸脱羧酶基因(pdc)的2条ESTs(BP099214和BP113195),以此设计引物,克隆获得球毛壳菌pdc基因的cDNA及DNA序列。cDNA和DNA序列长度分别为1725和1829bp,编码574个氨基酸的多肽,蛋白质分子质量63.38ku。蛋白质家族预测其属于焦磷酸硫胺素TPP家族。BlastP相似性分析表明,PDC氨基酸序列保守性不高,与其相似性最高的是柄孢霉的PDC(Podospora anserina,CAD60727),相似性为79%。pdc基因的cDNA及DNA序列在GenBank上的登录号分别为EU304327,EU304326。