草菇翻译起始因子Vv‐IF4E及与其共表达转录因子的研究

编号 zgly0001497147

文献类型 期刊论文

文献题名 草菇翻译起始因子Vv‐IF4E及与其共表达转录因子的研究

作者 陈仁良  严俊杰  陶永新  谢斌  张磊  吴塔菊  李少杰  谢宝贵 

作者单位 福建农林大学生命科学学院菌物研究中心  福建农林大学园艺学院  中国科学院微生物研究所 

母体文献 菌物学报 

年卷期 2015年04期

年份 2015 

分类号 S646.13 

关键词 草菇  蛋白质合成  荧光定量PCR  共表达  皮尔森相关系数 

文摘内容 真核翻译起始因子IF4E(initiation factor 4E)可通过与m RNA的5’帽子端结合,在蛋白质的翻译起始过程中扮演重要角色。草菇Volvariella volvacea是一种富有商业价值的食用真菌,其生长发育与蛋白质的合成代谢密切相关。本文通过鉴定草菇编码IF4E的基因(Vv-IF4E),并根据生物信息学和实时荧光定量数据分析Vv-IF4E及相关转录因子基因表达量的变化规律。结果显示,草菇Vv-IF4E基因上游存在较多顺式作用元件,基因存在4种可变剪切体,只有一种具有翻译起始因子的保守结构域。预测开放阅读框(ORF)长度为3 083bp,所编码蛋白分子量为87.1k Da,存在35个磷酸化位点。Vv-IF4E蛋白结构有异于拟南芥IF4E,但与皱木耳Auricularia delicata IF4E相似。实时荧光定量结果表明,Vv-IF4E与转录因子YRR1、ECM22存在极强的共表达规律。