基于全基因组重测序的SNP分析在作物基因定位中的研究进展

编号 zgly0001497362

文献类型 期刊论文

文献题名 基于全基因组重测序的SNP分析在作物基因定位中的研究进展

作者 袁金红  李俊华  黄小城  李莎  高武军 

作者单位 河南师范大学生命科学学院 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2015年09期

年份 2015 

分类号 Q943.2 

关键词 全基因组重测序  单核苷酸多态性  基因定位  数量性状位点 

文摘内容 在作物重要性状数量性状位点(quantitative trait locus,QTL)定位和突变体研究中,利用传统的遗传标记对目标基因或QTL进行定位,往往工作量大、周期长,难以精确定位。近年来,全基因组重测序(whole genome resequencing,WGR)为从基因组水平开发单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphysim,SNP)标记提供了新的技术条件。利用基于WGR的SNP识别、验证和基因型分析与传统分子标记相结合的方法,能很快挖掘到候选基因和获得导致表型的SNP位点。目前,通过基于WGR的群体驯化和全基因组关联分析以及对杂交后代进行全基因组SNP基因型分析,已经成功定位了若干作物的QTL及突变基因。本文就利用基于WGR的SNP分析方法定位作物重要性状QTL和突变基因的研究概况进行综述,并就该方法在基因/QTL定位上的应用前景进行了探讨和分析。