基于重测序信息的金针菇菌株资源遗传多样性及群体结构分析

编号 zgly0001710785

文献类型 期刊论文

文献题名 基于重测序信息的金针菇菌株资源遗传多样性及群体结构分析

作者 沈颖越  金群力  蔡为明  范丽军  冯伟林  宋婷婷 

作者单位 浙江省农业科学院园艺研究所 

母体文献 菌物学报 

年卷期 2020年06期

年份 2020 

分类号 S646.15 

关键词 金针菇  全基因组重测序  单核苷酸多态性  群体多样性  群体结构 

文摘内容 通过对来自国内外的28份金针菇菌株资源的重测序共计检测到SNP位点1241 583个,In Del位点623 670个。通过筛选分型,1 474个高质量SNP标记(多态信息含量指数PIC介于0.101–0.966之间)被用于金针菇资源群体多样性和结构分析。经计算,菌株间遗传距离在0.057–0.631之间。UPGMA进化树拓扑结构显示栽培菌株是其与野生菌株混合分支的一个亚支,自然栽培和工厂化栽培菌株可各自聚成一支,符合金针菇育种历史。群体结构结果显示金针菇种质资源包含5个亚群。主成分分析显示菌株在二主分之间的位置及互相间距离基本符合进化树分类、群体结构和遗传距离。本研究为金针菇分子标记和基因型的确定提供序列基础,也为后续资源保护利用、重要农艺性状的基因定位和基于分子标记的聚合育种提供理论依据。