柑橘鳞皮病毒3个分离物全基因组序列分析

编号 zgly0001651712

文献类型 期刊论文

文献题名 柑橘鳞皮病毒3个分离物全基因组序列分析

作者 李敏  周天宇  张松  杨方云  周彦  周常勇  李中安  曹孟籍 

作者单位 西南大学/中国农业科学院柑桔研究所 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2018年10期

年份 2018 

分类号 S436.66 

关键词 柑橘  柑橘鳞皮病毒  全基因组  系统发育分析 

文摘内容 运用转录组测序和RT-PCR方法克隆测定了柑橘鳞皮病毒(Citruspsorosisvirus,CPsV)3个分离物CHN-1、CHN-2和CHN-3的全基因组。序列分析结果表明,CHN-1、CHN-2和CHN-3的基因组全长分别为11 282、11 279和11 278 nt,均包含4个开放阅读框。CHN-1、CHN-2和CHN-3之间的核苷酸相似性为93.48%～95.98%,编码氨基酸相似性为98.18%～98.86%;与6个已知国外CPsV分离物的外壳蛋白基因核苷酸序列相似性为85.83%～95.23%,其对应氨基酸序列相似性为94.09%～99.32%。系统进化分析显示CHN-1、CHN-2和CHN-3与地中海沿岸国家的CPsV分离物聚为一簇,可能具有共同的起源。